Huperzia aqualupiana (Spring) Rothm EN
Nome atual: Phlegmariurus aqualupianus (Spring) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia aqualupiana (Spring) Rothm.; Lycopodium aqualupianum Spring; Urostachys aqualupianus (Spring) Herter;

Huperzia biformis (Hook.) Holub LC
Nome atual: Phlegmariurus biformis (Hook.) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia biformis (Hook.) Holub; Lycopodium biforme Hook.; Urostachys biformis (Hook.) Herter;

Huperzia catharinae (Christ) Holub DD
Outros nomes: Lycopodium catharinae Christ;

Huperzia christii (Silveira) Holub EN
Nome atual: Phlegmariurus christii (Silveira) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia christii (Silveira) Holub; Lycopodium christii Silveira; Urostachys christii (Silveira) Holub;

Huperzia flexibilis (Fée) B.Ollg. LC
Nome atual: Phlegmariurus flexibilis (Fée) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia flexibilis (Fée) B.Øllg.; Lycopodium flexibile Fée; Lycopodium linifolium Spring; Lycopodium linifolium var. sanguineum Spring; Lycopodium linifolium var. subaristatum Christ; Urostachys flexibilis (Fée) Herter;

Huperzia fontinaloides (Spring) Trevis. LC
Nome atual: Phlegmariurus fontinaloides (Spring) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia fontinaloides (Spring) Trevis.; Lycopodium fontinaloides Spring; Urostachys fontinaloides (Spring) Trevisan;

Huperzia hemleri (Nessel) B. Ollg. CR
Nome atual: Phlegmariurus hemleri (Nessel) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia hemleri (Nessel) B.Øllg.; Urostachys hemleri Nessel;

Huperzia hexasticha B.Ollg. & P.G.Windisch LC
Nome atual: Phlegmariurus hexastichus (B.Øllg. & P.G.Windisch) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia hexasticha B.Øllg. & P.G.Windisch;

Huperzia itambensis B. Ollg. & P.G.Windisch EN
Nome atual: Phlegmariurus itambensis (B.Øllg. & P.G.Windisch) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia itambensis B.Øllg. & P.G.Windisch;

Huperzia martii (Wawra) Holub EN
Nome atual: Phlegmariurus martii (Wawra) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia martii (Wawra) Holub; Lycopodium martii Wawra; Urostachys martii (Wawra) Holub;

Huperzia mollicoma (Spring) Holub EN
Nome atual: Phlegmariurus mollicomus (Spring) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia mollicoma (Spring) Holub; Lycopodium mollicomum Spring; Urostachys mollicomus (Spring) Nessel;

Huperzia mooreana (Baker) Holub EN
Nome atual: Phlegmariurus mooreanus (Baker) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia mooreana (Baker) Holub; Lycopodium moreanum Baker; Urostachys mooreanus (Baker) Herber;

Huperzia nuda (Nessel) B.Ollg. & P.G.Windisch EN
Nome atual: Phlegmariurus nudus (Nessel) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia nuda (Nessel) B.Øllg. & P.G.Windisch; Urostachys nudus Nessel;

Huperzia quadrifariata (Bory) Rothm. LC
Nome atual: Phlegmariurus quadrifariatus (Bory) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia quadrifariata (Bory) Rothm.; Lycopodium quadrangulare Spring; Lycopodium quadrifariatum Bory; Urostachys quadrifariatus (Bory) Rothm.;

Huperzia regnellii (Maxon) B.Ollg. & P.G.Windisch CR
Nome atual: Phlegmariurus regnellii (Maxon) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia regnellii (Maxon) B.Øllg. & P.G.Windisch; Lycopodium regnellii Maxon; Urostachys regnellii (Maxon) B.Øllg. & P.G.Windisch;

Huperzia rubra (Cham. & Schltdl.) Rothm. CR
Nome atual: Phlegmariurus ruber (Cham. & Schlecht.) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia rubra (Cham. & Schltdl.) Trevis.; Lycopodium rubrum Cham. & Schltdl.; Urostachys rubrus (Cham & Schltdl.) Nessel;

Huperzia sellowiana (Herter) B.Ollg. VU
Nome atual: Phlegmariurus sellowianus (Herter) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia sellowiana (Herter) B.Øllg.; Lycopodium sellowianum Herter; Urostachys sellowianus (Herter) Nessel;

Huperzia taxifolia (Sw.) Trevis. EN
Nome atual: Phlegmariurus taxifolius (Sw.) Á. Löve & D. Löve
Outros nomes: Huperzia taxifolia (Sw.) Trevis.; Lycopodium taxifolium Sw.; Urostachys taxifolius (Sw.) Herter;

Huperzia treitubensis (Silveira) B.Ollg. CR
Nome atual: Phlegmariurus treitubensis (Silveira) B.Øllg.
Outros nomes: Huperzia treitubensis (Silveira) B.Øllg.; Lycopodium treitubense Silveira; Urostachys treitubensis (Silveira) Nessel;

Lycopodiella benjaminiana P.G.Windisch EN
Nome atual: Pseudolycopodiella tatei (A.C.Smith) Holub
Outros nomes: Lycopodiella benjaminiana P.G.Windisch; Pseudolycopodiella benjaminiana (P.G.Wndisch) B.Øllg.;

Lycopodiella bradei (Herter) B.öllg. EN
Nome atual: Palhinhaea bradei (Herer) Holub
Outros nomes: Lycopodiella bradei (Herter) B.Øllg.; Lycopodium bradei Herter;

Lycopodium jussiaei Poir. EN
Nome atual: Diphasium jussiaei (Desv. ex Poir.) C. Presl ex Rothm.
Outros nomes: Lycopodium jussiaei Poir.; Lycopodium jussieui Poir.;